Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2Q9BX26 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms