Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms