Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf88Q9BSF0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms