Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM79Q9BSE2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms