Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBA1CQ9BQE3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms