Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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