Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms