Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms