Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT140Q96RY7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT140Q96RY7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms