Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FGD4Q96M96 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms