Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms