Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOLD1Q96LR9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms