Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIRT1Q96EB6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms