Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms