Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms