Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYDC1Q8WXC3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms