Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC4Q8WW27 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms