Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms