Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FUNDC1Q8IVP5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms