Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNE3Q6ZMZ3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms