Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms