Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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