Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD40Q6AI12 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms