Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTXN3Q4LDR2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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