Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms