Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KNOP1Q1ED39 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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