Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms