Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXNQ16595 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXNQ16595 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXNQ16595 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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