Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms