Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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