Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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