Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF13Q15543 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms