Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHBQ15464 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHBQ15464 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms