Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms