Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARHGEF6Q15052 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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