Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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