Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL9A3Q14050 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL9A3Q14050 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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