Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK13Q14004 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
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