Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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CUL4AQ13619 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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