Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms