Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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