Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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AP3B2Q13367 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms