Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK2Q13002 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK2Q13002 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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