Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FOXF2Q12947 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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