Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN2AQ12879 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
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