Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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