Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN1BQ07699 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCN1BQ07699 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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