Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms