Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms