Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms